Банки данных Swiss-Prot и UniProt

Данные банка Swiss-Prot о белке END4_ECOLI

Метка поля(line code) Запись
Стандартное имя последовательности(идентификатор последовательности) ID END4_ECOLI
Внутренний уникальный постоянный идентификатор документа AC P12638
Название белка, отражающее его функции DE Endonuclease IV (EC 3.1.21.2) (Endodeoxyribonuclease IV); Эндонуклеаза IV
Дата создания документа DT 01-OCT-1989 (Rel. 12, Created)
Дата последнего исправления аннотации DT 25-JAN-2005 (Rel. 46, Last annotation update)
Название организма OS Escherichia coli, and Escherichia coli O157:H7.
Полное название таксона OC Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia.
Длина последовательности SQ 285 а.о.
Молекулярная масса белка SQ 31480 г/моль
Число публикаций, использованных при создании документа RN 7
Название журнала с самой свежей публикацией RL DNA Res
Описание вторичной структуры FT Содержит информацию о последовательности аминокислотных остатков основных элементов вторичной структуры- альфа спиралей, бета-листов и поворотов.
Что содержит поле комментариев? CC Функция, каталитическая активность, кофактор, субъединицы, индуцировании, подобие
Какие особенности последовательности указаны? FT Указаны несоответствия между разными банками данных, информация об атомах металлов в белке.
Идентификатор файла PDB DR PDB; 1QTW;
PDB; 1QUM;

Документ банка данных Swiss-Prot с описанием END4_ECOLI

 

Результаты поиска в БД UniProt белков с тем же кратким описанием (DE), что и у белка END4_ECOLI

Поиск производился с помощью поисковой системы SRS(Sequence Retrieval System) (банк данных UniProt)

Таксон Запрос Количество найденных документов
Археи( Archaea) Description: Endonuclease IV | 3.1.21.2 | Endodeoxyribonuclease IV & Taxonomy: Archaea 13
Бактерии(Bacteria) Description: Endonuclease IV | 3.1.21.2 | Endodeoxyribonuclease IV & Taxonomy: Bacteria 88
Эукариоты (Eukaryota) Description: Endonuclease IV | 3.1.21.2 | Endodeoxyribonuclease IV& Taxonomy: Eukaryota 0

 

На главную страницу второго семестра


©Сухорукова Мария,2005